诺唯赞生物和真迈生物合作,联合发布转座酶RNA文库在真迈FASTASeq 300测序平台及NovaSeq 6000测序平台上的测评数据。
本次测试较为全面的评估转座酶RNA文库在两个测序平台上测序质量、微生物检出情况等方面的表现。
测试结果显示,诺唯赞提供的转座酶RNA文库在真迈生物FASTASeq 300测序平台及NovaSeq 6000测序平台均表现优异,且一致性较好。
01 测试方案
诺唯赞生物基于TruePrep RNA Library Prep Kit for illumina(Vazyme #TR501/502/503)试剂盒构建了模拟感染样本(293细胞total RNA模拟宿主核酸背景并掺入不同比例的微生物RNA)的转座酶RNA文库(下文简称微生物RNA文库),构建好的文库使用FASTASeq 300、NovaSeq 6000测序平台上机测序。
表1.微生物RNA文库构建方案02 测试结果
1、 测序数据质量表现优异
微生物RNA文库在两个测序平台的下机数据质量均非常优秀。
图1.不同文库在FASTASeq300和NovaSeq6000测序平台的数据质量2、微生物RNA检出reads数
数据分析表明,两种测序平台的微生物RNA检出Reads数相当,在掺入比例为1/1,000和1/10,000两种情况下均能有效检出微生物RNA。
图2.FASTASeq 300测序平台微生物RNA检出Reads数图3.NovaSeq 6000测序平台微生物RNA检出Reads数Vazyme #TR501/502/503构建出的微生物RNA文库在FASTASeq 300与NovaSeq 6000测序平台的下机数据质量优秀,均能有效检出占比低至1/10,000的微生物RNA。
03 产品介绍
诺唯赞重磅推出转座酶RNA建库试剂盒——TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #TR501-TR503),可快速高效建库,为mNGS的快速检测提供新方案。该产品采用新型的转座酶法对RNA/cDNA杂合链片段化,将繁琐的RNA片段化、二链合成、末端修复、dA-Tailing和接头连接等步骤转变为一步简单的酶促反应。
▶建库耗时短:超快速的RNA建库流程,建库时长缩短至2 h。
▶ 微生物检出灵敏度高:可检出低至1/10,000占比的微生物。
▶ 严格的背景菌质控:低背景菌残留。
图4.TruePrep RNA Library Prep Kit for Illumina建库流程关于FASTASeq 300测序平台
FASTASeq 300是一款主打靶向测序、全基因组低深度测序的中小通量桌面型基因测序系统,其沿用了GenoLab M基因测序系统使用的SURFseq测序技术,集成测序化学、高密度芯片、流体设计和碱基识别算法等方面的创新突破,为用户带来更多的使用扩展性、更稳定的数据质量及更快的交付速度。同时,FASTASeq 300基因测序系统可以兼容目前市面上主流的NGS文库制备产品和数据分析流程。
FASTASeq 300测序系统的技术优化和创新为用户提供了便捷、灵活的工作流程,让用户简单操作,轻松应对各类测序场景。